平成２７年（２０１５年）３月のダイヤ改正より、総武快速線を経由して東京〜館山駅間を結ぶ「特別快速」の運行が開始されました。平日に限り１日１往復（朝の下りと夜の上りにて）運行され、木更津〜館山駅間は増結車両（４両編成）のみで運行していました。当初は廃止された特急列車（平日に運行していた東京〜館山駅間の特急列車）の代替という位置付けで運行していましたが、２年後の平成２９年（２０１７年）３月のダイヤ改正を以って「特別快速」の運行は廃止となっています。

　　令和３年（２０２１年）３月のダイヤ改正より、木更津〜安房鴨川駅間においてワンマン運転対応の新型車両「Ｅ１３１系」による運行が開始されました。新型車両「Ｅ１３１系」２両編成（ワンマン運転）で運行する普通電車は、内房線の木更津駅から安房鴨川駅を経由し、外房線の上総一ノ宮駅まで直通運転を行っています（一部列車を除く）。新型車両「Ｅ１３１系」以外の車両で運行する普通電車は、引き続き車掌も乗務するツーマン運転での運行が行われています。

　　特急列車については、京葉線経由の「さざなみ号」が平日に限り東京〜君津駅間で運行され、朝の通勤ラッシュ時間帯に上り３本、夜の帰宅ラッシュ時間帯に下り５本（東京駅発１７時台から毎時１本）を運行しています。土休日には総武線経由の「新宿さざなみ号」が新宿〜館山駅間を２往復（朝上り２本、夕方下り２本）運行しています。

　　自動放送面では、本千葉・浜野・八幡宿・五井・姉ヶ崎・長浦・袖ヶ浦・君津の各駅が「旭型放送」（詳細放送）、巌根駅では「巌根型放送」（簡易放送）、蘇我・木更津の各駅ではＡＴＯＳ線区で用いられている「ＡＴＯＳ線区型放送」（詳細放送）、青堀〜那古船形の各駅では「内房線ＰＲＣ型放送」（詳細放送）、館山駅では「館山型放送」（簡易放送）、九重〜安房鴨川の各駅では「外房線ＰＲＣ型放送」（詳細放送）を使用しています。なお、安房鴨川駅では戸閉放送に「巌根型放送」（簡易放送）が使用されています。

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